SELEÇÃO DE INICIADORES MOLECULARES ISSR PARA ESTUDOS DE DIVERSIDADE GENÉTICA EM Handroanthus impetiginosus (MART. EX DC.) MATTOS
DOI:
https://doi.org/10.1590/1983-21252022v35n124rcPalavras-chave:
Árvore matriz. Conservação genética. Inter Simple Sequence Repeat. Semiárido.Resumo
Handroanthus impetiginosus é uma espécie arbórea com potencial ecológico e econômico. Apesar disso, no mercado brasileiro, a madeira é fortemente explorada no comércio ilegal. Portanto, tornam-se necessários estudos sobre diversidade genética com a finalidade de propor estratégias de conservação da espécie. Assim, o objetivo deste estudo foi selecionar iniciadores Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) para estudos de diversidade genética aplicados a população florestal de H. impetiginosus. Para isso, testaram-se 30 iniciadores moleculares ISSR em 30 indivíduos, avaliando-se o número total de loci, taxa de polimorfismo e valor de conteúdo da informação polimórfica, bem como o índice de marcador e o poder de resolução. Oito iniciadores foram selecionados por apresentarem melhor padrão de amplificação, os quais forneceram 62 loci. O valor do conteúdo de informação dos iniciadores polimórficos variou de 0,34 a 0,49, enquanto o valor do índice de marcador (MI) obteve uma média de 3,20, poder de resolução (RP) de 2,40, diversidade de Nei (He) de 0,35 e o índice de Shannon (I) de 0,52. Os resultados demonstram que os iniciadores UBC 807, 809, 818, 824, 857, 860, 873 e 881 são eficientes para a quantificação da diversidade genética de H. impetiginosus. Estes resultados podem contribuir para subsidiar estratégias que visem à conservação da espécie e seleção de árvores matrizes.
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Referências
ANDERSON, J. A. et al. Optimizing parental selection for genetic linkage maps. Genome, 36: 181-186, 1993.
ARAÚJO, F. et al. ISSR molecular markers for the study of the genetic diversity of Mimosa caesalpiniaefolia Benth. Idesia, 34: 47-52, 2016.
ARAÚJO, F. D. S. et al. Seed quality and genetic diversity of a cultivated population of Mimosa caesalpiniifolia Benth. Revista Caatinga, 33: 1000-1006, 2020.
BOTSTEIN, D. et al. Construction of genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms. American Journal of Human Genetics, 32: 314-331, 1980.
CHAGAS, K. P. T. et al. Seleção de marcadores ISSR e diversidade genética em uma população de Elaeis guineensis. Revista Brasileira de Ciências Agrárias, 10: 147-152, 2015.
COLLEVATTI, R. G. et al. High genetic diversity and contrasting fine-scale spatial genetic structure in four seasonally dry tropical forest tree species. Plant systematics and evolution, 300: 1671-1681, 2014.
COSTA, D. F. et al. Diversidade genética e seleção de iniciadores ISSR em uma população natural de mangaba (Hancornia speciosa Gomes) (Apocynaceae). Revista Brasileira de Fruticultura, 37: 970-976, 2015.
CRUZ, C. D. Programa GENES: versão Windows. Viçosa, MG: Editora UFV, 2001. 642 p.
DOYLE, J. J.; DOYLE, J. L. Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus, 12: 13-15, 1987.
FAJARDO, C. G.; VIEIRA, F.; MOLINA, W. F. Interspecific genetic analysis of orchids in Brazil using molecular markers. Plant Systematics and Evolution, 300: 1826-1832, 2014.
FELIX, F. C. et al. Applications of ISSR markers in studies of genetic diversity of Pityrocarpa moniliformis. Revista Caatinga, 33: 1017-1024, 2020.
FELIX, F. C. et al. Selection of Pityrocarpa moniliformis (Benth.) Luckow & R. W. Jobson mother trees for seeds production. Revista Brasileira de Ciências Agrárias, 16: 1-10, 2021.
FREIRE, A. D. S. M. et al. Genetic diversity in forest populations from conservation units in the Atlantic Rainforest in northeast Brazil. Revista Brasileira de Ciências Agrárias, 14:1-7, 2019.
KRUSKAL, J. B. Multidimensional scaling by optimizing goodness of fit to a no metric
hypothesis. Psychometrika, 29: 01-27, 1964.
LOPES, J. D. S.; COSTA, M. R. J.; ARRIEL, D. A. A. Genetic diversity of potential mother trees of Myracrodruon urundeuva Allemão in a remnant population from Brazilian Cerrado using ISSR. Advances in Forestry Science, 7: 1017-1024, 2020.
MARTINELLI, G.; MORAES, M. A. Livro vermelho da flora do Brasil. Rio de Janeiro, RJ: Instituto de Pesquisas Jardim Botânico do Rio de Janeiro, 2013. 818 p.
NEI, M. Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individuals. Genetics, 89: 584-590, 1978.
NYBOM, H. Comparison of different nuclear DNA markers for estimating intraspecific genetic diversity in plants. Molecular Ecology, 13: 1143-1155, 2004.
PREVOST, A.; WILKINSON, M. J. A new system of comparing PCR primers applied to ISSR fingerprinting of potato cultivars. Theoretical Applied Genetics, 98: 107- 112, 1999.
RAJASEKHARAN, P. E. et al. Genetic diversity in Oroxylum indicum (L.) Vent, a threatened medicinal plants from India by ISSR analysis. Indian Journal of Biotechnology, 16: 357-363, 2017.
RAVI, R. D.; SIRIL, E. A.; NAIR, B. R. The efficiency of Cytochrome P450 gene-based markers in accessing genetic variability of drumstick (Moringa oleifera Lam.) accessions. Molecular Biology Reports, 47: 2929-2939, 2020.
ROHLF, F. J. Numerical taxonomy and multivariate analysis system: version 1.8. 1. ed. Setauket, New York: Exeter Software, 1993. 43 p.
ROSA, J. et al. Variability and population genetic structure in Achyrocline flaccida (Weinm.) DC. a species with high value in folk medicine in South America. Plos one, 12: 1-19, 2017.
SEBBENN, A. M. Número de árvores matrizes e conceitos genéticos na coleta de sementes para reflorestamentos com espécies nativas. Revista do Instituto Florestal, 14: 115-132, 2002.
SCHLINDWEIN, C. et al. Visual signalling of nectar-offering flowers and specific morphological traits favour robust bee pollinators in the mass-flowering tree Handroanthus impetiginosus (Bignoniaceae). Botanical Journal of the Linnean Society, 176: 396-407, 2014.
SILVA JUNIOR, O. B. et al. Genome assembly of the Pink Ipê (Handroanthus impetiginosus, Bignoniaceae), a highly valued, ecologically keystone Neotropical timber forest tree. GigaScience, 7: 120-125, 2017.
SOUZA, L. C. et al. Validação do marcador molecular ISSR para detecção de diversidade genética em Plathymenia reticulata Benth. Revista Brasileira de Ciências Agrárias, 13: 1-6, 2018.
TELLES, M. P. C. et al. Disentangling landscape effects on population genetic structure of a Neotropical savanna tree. Brazilian Journal of Nature Conservation, 1: 65-70, 2014.
VARSHNEY, R. K. et al. Comparative assessment of ESTSSR, EST-SNP and AFLP markers for evaluation of genetic diversity and conservation of genetic resources using wild, cultivated and elite barleys. Plant Science, 173: 628-649, 2007.
VIEIRA, F. A. et al. Diversidade genética de Copernicia prunifera com o uso de marcadores moleculares ISSR. Revista Brasileira de Ciências Agrárias, 10: 525-531, 2015.
VINSON, C. C. et al. Using molecular markers to investigate genetic diversity, mating system and gene flow of Neotropical trees. Brazilian Journal of Botany, 41: 481-496, 2018.
YEH, F. C. et al. Pop-gene, theuser-friendly shareware for population genetic analysis molecular biology and biotechnology center. Edmonton: Molecular Biology and Biotechnology, 1997.
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