Predição Estrutural e Funcional In Silico de Peptídeos Antimicrobianos Vegetal a Partir do Banco de Dados oneKp
PABLO FEITOSA
Ufersa
Isadora Louise da Costa Ribeiro Quintans
Lara Vitoria Bezerra
Palavras-chave: Bioinformática, Predição Antimicrobiana, Modelagem tridimensional
Resumo
A resistência a antibióticos é um grave problema de saúde pública global, resultante da capacidade de microrganismos desenvolverem resistência a fármacos comumente utilizados. Diante desse cenário, torna-se essencial a busca por novas estratégias para combater essa ameaça. As proteínas de transferência de lipídios (LTPs) destacam-se como pequenos peptídeos ricos em cisteína, conhecidos por sua alta estabilidade estrutural e notável potencial antimicrobiano. Com isso, o prezado estudo teve o objetivo de analisar sistematicamente sequências obtidas do banco de dados OneKP, permitindo a seleção de candidatos com domínios conservados e a identificação de variantes estruturais pouco exploradas. Para isso, as sequências foram recuperadas no banco de dados NCBI e avaliadas quanto à presença de peptídeos sinal utilizando o SignalP 6.0. Em seguida, as sequências foram alinhadas no programa T-Coffee. Os peptídeos foram caracterizados quanto às suas propriedades físico-químicas por meio do módulo Bio.SeqUtils.ProtParam da biblioteca Biopython, avaliados quanto à probabilidade de formação de agregados insolúveis com o EMBOSS pepstats e quanto ao potencial antimicrobiano no CAMPr4. As estruturas tridimensionais foram preditas utilizando o AlphaFold2. O alinhamento de sequências revelou heterogeneidade nos padrões de resíduos de cisteína, com predominância de seis ou oito resíduos. As análises físico-químicas evidenciaram variações em estabilidade, carga e propensão à agregação. Os modelos preditivos indicaram que mais da metade das sequências apresentam potencial antimicrobiano, sustentado por boa solubilidade e baixa tendência à agregação. A modelagem estrutural confirmou a alta qualidade das proteínas com maior conteúdo de cisteína, além de revelar divergências conformacionais em subgrupos específicos. Em conjunto, os resultados sugerem que as LTPs representam uma fonte promissora de novos agentes antimicrobianos, oferecendo subsídios relevantes tanto para pesquisas fundamentais quanto para aplicações biotecnológicas futuras.