PERFIL DE AMPLIFICAÇÃO E SELEÇÃO DE MARCADORES ISSR PARA ESTUDOS GENÉTICOS EM Calotropis procera

Cibelle Santos Dias; Luiz Henrique Tolentino Santos; Messulan Rodrigues Meira; Elisa Susilene Lisboa dos Santos; Carlos Bernard Moreno Cerqueira-Silva

doi:10.1590/1983-21252022v35n325rc

Autores

Cibelle Santos Dias Posgraduate Program in Environmental Sciences, Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia, Itapetinga, BA https://orcid.org/0000-0001-9694-8485
Luiz Henrique Tolentino Santos Postgraduate Program in Animal Science, Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia, Itapetinga, BA https://orcid.org/0000-0002-9419-6192
Messulan Rodrigues Meira Posgraduate Program in Environmental Sciences, Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia, Itapetinga, BA https://orcid.org/0000-0003-2447-342X
Elisa Susilene Lisboa dos Santos Deparment of Exact and Natural Sciences, Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia, Itapetinga, BA https://orcid.org/0000-0003-3644-3519
Carlos Bernard Moreno Cerqueira-Silva Deparment of Exact and Natural Sciences, Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia, Itapetinga, BA https://orcid.org/0000-0002-1883-4543

DOI:

https://doi.org/10.1590/1983-21252022v35n325rc

Palavras-chave:

Diversidade genética. Flor de seda. Marcadores moleculares. Polimorfismo.

Resumo

Algodão de seda é uma espécie vegetal adaptada a vários ecossistemas e tem se destacado pela importância econômica e ecológica. Nós avaliamos o perfil de amplificação de 23 iniciadores ISSR e selecionamos loci polimórficos para estudos genéticos de uma população natural de Calotropis procera por meio da coleta e extração de DNA genômico de 33 indivíduos. O DNA genômico foi extraído usando o protocolo sorbitol e CTAB 2% e os produtos de amplificação ISSR foram resolvidos por eletroforese. Com base no perfil de amplificação, os 23 iniciadores foram classificados como adequados, razoáveis e inadequados. Descrevemos a qualidade dos iniciadores considerando o número total de bandas, média das bandas por iniciador, porcentagem de polimorfismo, diversidade genética de Nei (heterozigosidade esperada - He), assumindo o equilíbrio de Hardy-Weinberg e conteúdo das informações polimórficas (PIC). Todos os iniciadores ISSR apresentaram perfil de amplificação, os quais geraram 173 marcas com média de 7,5 loci por iniciador. Porém, dos 23 iniciadores testados, apenas 18 permitiram amplificação visível e de alta qualidade, que foram classificados como adequado e polimórfico. Também observamos média de 0,30 e 0,24 para as estimativas de PIC e He, respectivamente. Os iniciadores DiCA3`RG, TriAGA3`RC e TriCGC3`RC foram altamente transferíveis para C. procera (apresentaram qualidade para amplificação com boa reprodutibilidade), com valores de PIC superiores a 0,40, He superior a 0,30 e polimorfismo superior a 86%.

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