BAYESIAN INFERENCE IN THE GENETIC EVALUATION OF THE BRAZILIAN NORTHEAST TABAPUÃ CATTLE

Authors

  • Aracele Prates de Oliveira Fapepi/CNPq, Corrente (PI), Brasil.
  • Carlos Henrique Mendes Malhado Professor Titular da Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia (UESB)
  • Leandro Teixeira Barbosa Professor da Universidade Federal de Sergipe
  • Raimundo Martins Filho Professor Visitante Nacional Sênior Universidade Federal do Ceará, Campus da Universidade Federal do Ceará no Cariri.
  • Paulo Luiz Souza Carneiro Professor Pleno Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia, Campus de Jequié, Departamento de Ciências Biológicas.

DOI:

https://doi.org/10.1590/1983-21252015v28n425rc

Keywords:

Genetic correlation. Genetic gain. Heritability. Genetic tendency. Zebu.

Abstract

The objective was to compare models by Bayes factor (BF) to estimate the (co)variance components, genetic parameters and genetic values for the adjusted weights at 205 (W205), 365 (W365) and 550 (W550) days of age in Tabapuã animals reared on pasture in the Brazilian Northeast. Information about 26,838 cattle born in the period from 1975 to 2007 originally from the weight-development-control system of the Brazilian Association of Zebu Farmers (Associação Brasileira de Criadores de Zebu, ABCZ) was used. The (co)variance components and genetic parameters were estimated by the Bayesian approach, in single- and two-trait analysis, using the GIBBS3F90 software. The full model provided the best fit to estimate the breeding value for W205 and W365 characteristics parameters. For trait W550, the model that provided the best fit was the one that did not include the effect of permanent environment. Genetic trends of direct effect were significant for the W205, W365 and W550 features, corresponding to increments of 2.67 kg, 7.35 kg and 8.32 kg, respectively, during the 32 years evaluated. Phenotypic trends were significant only for W205 and W365 characteristics corresponding to increments of 26.82 kg and 22.42 kg, respectively. The genetic correlations between weight at 205, 365 and 550 days of age were of high magnitude (P205P365 = 0.90, = 0.90 and P205P550 P365P550 = 0.98); you can obtain genetic gains via correlated response to the weights at 365 and 550 days old when selecting for W205.

Downloads

Download data is not yet available.

Author Biographies

Aracele Prates de Oliveira, Fapepi/CNPq, Corrente (PI), Brasil.

Doutora em Zootecnia pela Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia

Carlos Henrique Mendes Malhado, Professor Titular da Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia (UESB)

Departamento de Ciências Biológicas. Tem experiência na área de análise de dados e Melhoramento Genético Animal.

Leandro Teixeira Barbosa, Professor da Universidade Federal de Sergipe

Centro de Ciências Biológicas e da Saúde, Departamento de Zootecnia

Raimundo Martins Filho, Professor Visitante Nacional Sênior Universidade Federal do Ceará, Campus da Universidade Federal do Ceará no Cariri.

Professor Visitante Nacional Sênior Universidade Federal do Ceará, Campus da Universidade Federal do Ceará no Cariri.Tem experiência na área de Zootecnia, com ênfase em Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos, atuando principalmente nos seguintes temas: preservação, produção e reprodução de caprinos, ovinos e bovinos

Paulo Luiz Souza Carneiro, Professor Pleno Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia, Campus de Jequié, Departamento de Ciências Biológicas.

Tem experiência na área de Zootecnia, com ênfase em Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos, atuando principalmente nos seguintes temas: avaliação genética, estrutura genética de populações, conservação de recursos genéticos (ovinos, caprinos e aves) e análise de dados moleculares.

References

ASSOCIAÇÃO BRASILEIRA DOS CRIADOS DE TABAPUÃ. Disponível em: <http:// tabapua.org.br/raca-tabapua/historia-da-raca/>. História da Raça . Acessado em 11 de Maio de 2014.

BALDI, F.; ALENCAR, M. M.; ALBUQUERQUE, L. G. Estimativas de parâmetros genéticos para características de crescimento em bovinos da raça Canchim utilizando modelos de dimensão finita. Revista Brasileira de Zootecnia, Viçosa, v. 39, n. 11, p. 2409-2417, 2010.

BARBOSA, L. et al. Estimação de parâmetros genéticos em suínos usando Amostrador de Gibbs. Revista Brasileira de Zootecnia, Viçosa, v. 37, n. 7, p. 1200-1206, 2008.

BOLIGON, A. A. et al. Influence of dat struture on the estimation of the additive genetic direct and maternal covariance for early growth traits in Nellore cattle. Livestock Science, Amsterdam: Elsevier B.V., v. 145, n.1, p. 212-218, 2012.  

CAIRES, D. N. et al. Tabapuã breed in Northeastern Brazil: genetic progress and population structure. Revista Brasileira de Zootecnia, Viçosa, v. 41, n. 8, p. 1858-1865, 2012.

CARDOSO, F. F. Manual de utilização do Programa INTERGEN – Versão 1.0 em estudos de genética quantitativa animal. Bagé. Embrapa Pecuária Sul, 2008. 75p. ( Documentos / Embrapa Pecuária Sul, ISSN 1982-5390 ; 74).

CARNEIRO JÚNIOR, J. M. et al. Predição de valores genéticos utilizando inferência bayesiana e frequentista em dados simulados. Acta Scientiarum Animal Sciences, Maringá, v. 32, n. 3, p. 337-344, 2010.

CUCCO, D. C. et al. Genetic parameters for postweaning traits in Braunvieh cattle. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 9, n.1, p. 545-553, 2010.

CYRILLO, J. N. S.G. et al. Modelagem e estimação de parâmetros genéticos e fenotípicos para pesos do nascimento à seleção (378 dias) de machos Nelore. Revista Brasileira de Zootecnia, Viçosa, v. 33, n. 6, p. 1405-1415, 2004.

DIAS, L.T. et al. Estimação de Parâmetros Genéticos para Peso em Diferentes Idades para Animais da Raça Tabapuã. Revista Brasileira de Zootecnia, Viçosa, v. 34, n. 6, p. 1914-1919, 2005.

FERNANDES, H. D.; FERREIRA, G. B. Estudo comparativo de sete modelos estatísticos para a característica ganho de peso em bovinos de corte. Revista Brasileira de Zootecnia, Viçosa, v. 29, n. 5, p. 1340-1348, 2000.

GEWEKE, J. Evaluating the accuracy of sampling-based approaches to the calculation of posterior moments. In: BERNARDO, J.M. BERGER, J.O., DAWID, A.P. & SMITH, A.F.M. (Ed.) Bayesian Statistics 4. New York: Oxford University, 1992. cap.4, p.169-194.

JACINTO, E. J. et al. Adequação de modelos para estimativa de parâmetros genéticos relativos ao peso aos P205 de idade em bovinos da raça Tabapuã, criados na região Nordeste. Revista Ciência Agronômica, Fortaleza, v. 36, n. 2, p. 221-226, 2005.

MALHADO, C. H. M. et al. Progresso genético e estrutura populacional do rebanho Nelore no Estado da Bahia. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v. 43, n. 9, p. 1163-1169, 2008.

MISZTAL,J.2012. Fortran Programs. Disponível em: <http://nce.ads.uga.edu/wiki/doku.php?id= Readme.gibbs3>. Acesso em 13 de outubro 2012.

RAFTERY, A. L.; LEWIS, S. One long run with diagnostics: implementation strategies 474 for Markov chain Monte Carlo [Comment]. Statistical Science, Hayward, v. 7, n. 4, p. 475 493-497, 1992.

R DEVELOPMENT CORE TEAM. R: a language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria ,2008. Disponível em: <http://www.r-project.org/>. Acesso em outubro de 2012.

RIBEIRO, S. H. A. et al. Estudo genético-quantitativo de características de crescimento na raça Tabapuã. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, Belo Horizonte, v. 59, n. 2, p. 473-480, 2007.

SANTOS, P. F. et al. Correlação genética, fenotípica e ambiental do desenvolvimento ponderal em bovinos da raça nelore variedade mocha. Archives of Veterinary Science, Curitiba, v. 10, n. 2, p. 55-60, 2005.

SAS INSTITUTE. Statistical Analysis System user’s guide. Version 9.1. Cary, USA, 2003.

SCARPATI, M. T. V.; LÔBO, R. B. Modelos animais alternativos para estimação de componentes de covariância e de parâmetros genéticos e fenotípicos de peso ao nasce na raça Nelore. Revista Brasileira de Zootecnia, Viçosa, v. 28, n. 3,p. 512-518,1999.

SEARLE, S.R. Variance components in the unbalanced 2-way nested classification. Annals of Mathematical Statistics, Durham, North Carolina, v. 32, n.4, p. 1161-1166, 1961.

SMITH, B. J. Bayesian output analysis program (BOA) version 1.1.7.2 User’s manual. Iowa: University Of Iowa., 2007.

Downloads

Published

19-11-2015

Issue

Vol. 28 No. 4 (2015)

Section

Zootechnics

License

Os Autores que publicam na Revista Caatinga concordam com os seguintes termos:

 

a)      Os Autores mantêm os direitos autorais e concedem à revista o direito de primeira publicação, com o trabalho simultaneamente licenciado sob a Licença Creative Commons  do tipo atribuição CC-BY, para todo o conteúdo do periódico, exceto onde estiver identificado, que permite o compartilhamento do trabalho com reconhecimento da autoria e publicação inicial nesta revista, sem fins comerciais.

 b)     Os  Autores têm autorização para distribuição não-exclusiva da versão do trabalho publicada nesta revista (ex.: publicar em repositório institucional ou como capítulo de livro), com reconhecimento de autoria e publicação inicial nesta revista.

 c)     Os  Autores têm permissão e são estimulados a publicar e distribuir seu trabalho online (ex.: em repositórios institucionais ou na sua página pessoal) a qualquer ponto antes ou durante o processo editorial, já que isso pode gerar alterações produtivas, bem como aumentar o impacto e a citação do trabalho publicado (Veja O Efeito do Acesso Livre).