APLICAÇÕES DE MARCADORES ISSR EM ESTUDOS DE DIVERSIDADE GENÉTICA DE Pityrocarpa moniliformis

Palavras-chave: Semiárido. Conservação. Florestas secas. Inter Simple Sequence Repeat. Marcadores moleculares.

Resumo

Pityrocarpa moniliformis (Benth.) Luckow & R. W. Jobson (Fabaceae) é uma espécie nativa do Brasil com alto potencial em programas de desenvolvimento econômico em regiões semiáridas, principalmente relacionado à produção de mel, alimentação animal e madeira para lenha. Assim, o objetivo deste trabalho foi selecionar marcadores moleculares Inter-Simple Sequence Repeat (ISSR) para estudos de diversidade genética, bem como testar a eficiência desta abordagem na quantificação da diversidade genética de uma população natural de P. moniliformis. Para isso, testaram-se 28 marcadores moleculares ISSR, avaliando-se o número total de locos, taxa de polimorfismo e o valor de conteúdo de informação polimórfica (PIC) para os iniciadores selecionados, bem como o índice de marcador e o poder de resolução. Os parâmetros de diversidade genética (distância genética de Nei e índice de Shannon) foram avaliados em 30 indivíduos localizados em Macaíba, Rio Grande do Norte, Brasil. Foram selecionados sete iniciadores que forneceram 74 locos, sendo 82% polimórficos, enquanto o valor de PIC foi de 0,344. A distância genética de Nei foi de 0,244 e o índice de Shannon, de 0,374. Portanto, marcadores moleculares ISSR (UBC 827, 840, 844, 857, 859, 860 e 873) são considerados eficientes nos estudos de diversidade genética de populações, seleção de matrizes e bancos de germoplasma, e podem contribuir para a conservação e o melhoramento genético em populações de P. moniliformis.

Referências

ALVES, M. J. et al. Phenols, flavonoids and antioxidant and cytotoxic activity of leaves, fruits, peel of fruits and seeds of Piptadenia moniliformis Benth (Leguminosae – Mimosoideae). Boletín Latinoamericano y del Caribe de Plantas Medicinales y Aromáticas, 13: 466-476, 2014.

ANDERSON, J. A. et al. Optimizing parental selection for genetic linkage maps. Genome, 36: 181-186, 1993.

ARAÚJO, F. S. et al. ISSR molecular markers for the study of the genetic diversity of Mimosa caesalpiniaefolia Benth. Idesia, 34: 47-52, 2016.

AZERÊDO, G. A.; PAULA, R. C.; VALERI, S. V. Determining the viability of Piptadenia moniliformis Benth seeds with the tetrazolium test. Journal of Seed Science, 33: 61-68, 2011.

BALLESTA, P. et al. Analysis of the genetic diversity of Eucalyptus cladocalyx (sugar gum) using ISSR markers. Acta Scientiarum - Agronomy, 37: 133-140, 2015.

BOTSTEIN, D. et al. Construction of genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms. American Journal of Human Genetics, 32: 314-331, 1980.

CHAGAS, K. P. T. et al. Genetic diversity of long-established populations of Elaeis guineensis Jacquin (Arecaceae). Revista Brasileira de Fruticultura, 41: e023, 2019.

CHEN, Y. et al. Genetic diversity and variation of Chinese fir from Fujian province and Taiwan, China, based on ISSR markers. Plos One, 12: 01-14, 2017.

COSTA, D. F. et al. Genetic diversity and selection of ISSR primers in a natural mangaba population (Hancornia speciosa Gomes) (Apocynaceae). Revista Brasileira de Fruticultura, 37: 970-976, 2015.

COSTA, J. C. et al. Genetic diversity in natural populations of Stylosanthes scabra using ISSR markers. Genetics and Molecular Research, 17: 1-8, 2018.

COSTA, T. S. et al. Genetic diversity of accessions of the mangaba germplasm bank in Sergipe, Brazil. Pesquisa Agropecuária Brasileira, 46: 499-508, 2011.

DOYLE, J. J.; DOYLE, J. L. Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus, 12: 13-15, 1987.

DUARTE, M. M.; NOGUEIRA, A. C.; VIEIRA, E. S. N. Diversity and spatial genetic structure of natural populations of Ziziphus joazeiro Mart. Brazilian Journal of Agricultural Sciences, 13: e5573, 2018.

FARIAS, D. F. et al. Water extracts of brazilian leguminous seeds as rich sources of larvicidal compounds against Aedes aegypti L. Anais da Academia Brasileira de Ciências, 82: 585-594, 2010.

FAJARDO, C. G. et al. Genetic and phenotypic association of the carnauba palm tree evaluated by inter-simple sequence repeat and biometric traits. Genetics and Molecular Research, 17: 1-9, 2018.

GONÇALVES, L. O. et al. Caracterização genética de mulungu (Erythrina velutina Willd.) em áreas de baixa ocorrência. Revista de Ciência Agronômica, 45: 290-298, 2014.

GOOGLE EARTH PRO. Google Earth Pro para PC, Mac ou Linux. Disponível em: <https://www.google.com.br/earth/download/gep/agree.html>. Acesso em: 01 jul. 2018.

JESUS, M. C. et al. Study of pollen from light honeys produced in Piauí State, Brazil. Palynology, 39: 110-124, 2015.

KOUR, B. et al. In vitro mass multiplication and assessment of genetic stability of in vitro raised Artemisia absinthium L. plants using ISSR and SSAP molecular markers, Advances in Botany, 2014: 01-07, 2014.

KRUSKAL, J. B. Multidimensional scaling by optimizing goodness of fit to a no metric hypothesis. Psychometrika, 29: 1-27, 1964.

LOPES, J. S.; COSTA, M. R. J.; ARRIEL, D. A. A. Genetic diversity of potential mother trees of Myracrodruon urundeuva Allemão in a remnant population from Brazilian Cerrado using ISSR. Advances in Forestry Science, 7: 1017-1024, 2020.

LORENZONI, R. M. et al. Using ISSR for finger printing accessions of biribazeiro. Revista Brasileira de Fruticultura, 36: 251-257, 2014.

NASCIMENTO, M. F. et al. OSB panels made with wood species from the Brazilian Northeast's Caatinga. Ambiente Construído, 15: 41-48, 2015.

NEVES, A. G. S. et al. Selection of ISSR molecular primers for genetic variability studies of Syagrus cearensis Noblick. Agropecuária Científica no Semiárido, 15: 228-231, 2019.

NING, Z. et al. Core germplasm construction of Cornus officinalis by ISSR markers. Journal of Agricultural Biotechnology, 2: 579-587, 2017.

NYBOM, H. Comparison of different nuclear DNA markers for estimating intraspecific genetic diversity in plants. Molecular Ecology, 13: 1143-1155, 2004.

PREVOST, A.; WILKINSON, M. J. A new system of comparing PCR primers applied to ISSR fingerprinting of potato cultivars. Theoretical and Applied Genetics, 98: 107-112, 1999.

ROSA, J. D. et al. Variability and population genetic structure in Achyrocline flaccida (Weinm.) DC., a species with high value in folk medicine in South America. Plos One, 12: e0183533, 2017.

SILVA, T. S. S. et al. Caracterização e seleção de marcadores moleculares em Croton linearifolius Mull. Arg. como subsídio para estudos genéticos. Multi-Science Journal, 1: 04-08, 2018.

SIMON, M. F. Manual de curadores de germoplasma - vegetal: conservação in situ. Brasília: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, Colombo, 322: 1-14, 2010.

VARSHNEY, R. K. et al. Comparative assessment of ESTSSR, EST-SNP and AFLP markers for evaluation of genetic diversity and conservation of genetic resources using wild, cultivated and elite barleys. Plant Science, 173: 628-649, 2007.

Publicado
2020-10-21
Seção
Ciências Florestais