APLICAÇÕES DE MARCADORES ISSR EM ESTUDOS DE DIVERSIDADE GENÉTICA DE Pityrocarpa moniliformis
DOI:
https://doi.org/10.1590/1983-21252020v33n417rcPalavras-chave:
Semiárido. Conservação. Florestas secas. Inter Simple Sequence Repeat. Marcadores moleculares.Resumo
Pityrocarpa moniliformis (Benth.) Luckow & R. W. Jobson (Fabaceae) é uma espécie nativa do Brasil com alto potencial em programas de desenvolvimento econômico em regiões semiáridas, principalmente relacionado à produção de mel, alimentação animal e madeira para lenha. Assim, o objetivo deste trabalho foi selecionar marcadores moleculares Inter-Simple Sequence Repeat (ISSR) para estudos de diversidade genética, bem como testar a eficiência desta abordagem na quantificação da diversidade genética de uma população natural de P. moniliformis. Para isso, testaram-se 28 marcadores moleculares ISSR, avaliando-se o número total de locos, taxa de polimorfismo e o valor de conteúdo de informação polimórfica (PIC) para os iniciadores selecionados, bem como o índice de marcador e o poder de resolução. Os parâmetros de diversidade genética (distância genética de Nei e índice de Shannon) foram avaliados em 30 indivíduos localizados em Macaíba, Rio Grande do Norte, Brasil. Foram selecionados sete iniciadores que forneceram 74 locos, sendo 82% polimórficos, enquanto o valor de PIC foi de 0,344. A distância genética de Nei foi de 0,244 e o índice de Shannon, de 0,374. Portanto, marcadores moleculares ISSR (UBC 827, 840, 844, 857, 859, 860 e 873) são considerados eficientes nos estudos de diversidade genética de populações, seleção de matrizes e bancos de germoplasma, e podem contribuir para a conservação e o melhoramento genético em populações de P. moniliformis.
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Referências
ALVES, M. J. et al. Phenols, flavonoids and antioxidant and cytotoxic activity of leaves, fruits, peel of fruits and seeds of Piptadenia moniliformis Benth (Leguminosae – Mimosoideae). Boletín Latinoamericano y del Caribe de Plantas Medicinales y Aromáticas, 13: 466-476, 2014.
ANDERSON, J. A. et al. Optimizing parental selection for genetic linkage maps. Genome, 36: 181-186, 1993.
ARAÚJO, F. S. et al. ISSR molecular markers for the study of the genetic diversity of Mimosa caesalpiniaefolia Benth. Idesia, 34: 47-52, 2016.
AZERÊDO, G. A.; PAULA, R. C.; VALERI, S. V. Determining the viability of Piptadenia moniliformis Benth seeds with the tetrazolium test. Journal of Seed Science, 33: 61-68, 2011.
BALLESTA, P. et al. Analysis of the genetic diversity of Eucalyptus cladocalyx (sugar gum) using ISSR markers. Acta Scientiarum - Agronomy, 37: 133-140, 2015.
BOTSTEIN, D. et al. Construction of genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms. American Journal of Human Genetics, 32: 314-331, 1980.
CHAGAS, K. P. T. et al. Genetic diversity of long-established populations of Elaeis guineensis Jacquin (Arecaceae). Revista Brasileira de Fruticultura, 41: e023, 2019.
CHEN, Y. et al. Genetic diversity and variation of Chinese fir from Fujian province and Taiwan, China, based on ISSR markers. Plos One, 12: 01-14, 2017.
COSTA, D. F. et al. Genetic diversity and selection of ISSR primers in a natural mangaba population (Hancornia speciosa Gomes) (Apocynaceae). Revista Brasileira de Fruticultura, 37: 970-976, 2015.
COSTA, J. C. et al. Genetic diversity in natural populations of Stylosanthes scabra using ISSR markers. Genetics and Molecular Research, 17: 1-8, 2018.
COSTA, T. S. et al. Genetic diversity of accessions of the mangaba germplasm bank in Sergipe, Brazil. Pesquisa Agropecuária Brasileira, 46: 499-508, 2011.
DOYLE, J. J.; DOYLE, J. L. Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus, 12: 13-15, 1987.
DUARTE, M. M.; NOGUEIRA, A. C.; VIEIRA, E. S. N. Diversity and spatial genetic structure of natural populations of Ziziphus joazeiro Mart. Brazilian Journal of Agricultural Sciences, 13: e5573, 2018.
FARIAS, D. F. et al. Water extracts of brazilian leguminous seeds as rich sources of larvicidal compounds against Aedes aegypti L. Anais da Academia Brasileira de Ciências, 82: 585-594, 2010.
FAJARDO, C. G. et al. Genetic and phenotypic association of the carnauba palm tree evaluated by inter-simple sequence repeat and biometric traits. Genetics and Molecular Research, 17: 1-9, 2018.
GONÇALVES, L. O. et al. Caracterização genética de mulungu (Erythrina velutina Willd.) em áreas de baixa ocorrência. Revista de Ciência Agronômica, 45: 290-298, 2014.
GOOGLE EARTH PRO. Google Earth Pro para PC, Mac ou Linux. Disponível em: <https://www.google.com.br/earth/download/gep/agree.html>. Acesso em: 01 jul. 2018.
JESUS, M. C. et al. Study of pollen from light honeys produced in Piauí State, Brazil. Palynology, 39: 110-124, 2015.
KOUR, B. et al. In vitro mass multiplication and assessment of genetic stability of in vitro raised Artemisia absinthium L. plants using ISSR and SSAP molecular markers, Advances in Botany, 2014: 01-07, 2014.
KRUSKAL, J. B. Multidimensional scaling by optimizing goodness of fit to a no metric hypothesis. Psychometrika, 29: 1-27, 1964.
LOPES, J. S.; COSTA, M. R. J.; ARRIEL, D. A. A. Genetic diversity of potential mother trees of Myracrodruon urundeuva Allemão in a remnant population from Brazilian Cerrado using ISSR. Advances in Forestry Science, 7: 1017-1024, 2020.
LORENZONI, R. M. et al. Using ISSR for finger printing accessions of biribazeiro. Revista Brasileira de Fruticultura, 36: 251-257, 2014.
NASCIMENTO, M. F. et al. OSB panels made with wood species from the Brazilian Northeast's Caatinga. Ambiente Construído, 15: 41-48, 2015.
NEVES, A. G. S. et al. Selection of ISSR molecular primers for genetic variability studies of Syagrus cearensis Noblick. Agropecuária Científica no Semiárido, 15: 228-231, 2019.
NING, Z. et al. Core germplasm construction of Cornus officinalis by ISSR markers. Journal of Agricultural Biotechnology, 2: 579-587, 2017.
NYBOM, H. Comparison of different nuclear DNA markers for estimating intraspecific genetic diversity in plants. Molecular Ecology, 13: 1143-1155, 2004.
PREVOST, A.; WILKINSON, M. J. A new system of comparing PCR primers applied to ISSR fingerprinting of potato cultivars. Theoretical and Applied Genetics, 98: 107-112, 1999.
ROSA, J. D. et al. Variability and population genetic structure in Achyrocline flaccida (Weinm.) DC., a species with high value in folk medicine in South America. Plos One, 12: e0183533, 2017.
SILVA, T. S. S. et al. Caracterização e seleção de marcadores moleculares em Croton linearifolius Mull. Arg. como subsídio para estudos genéticos. Multi-Science Journal, 1: 04-08, 2018.
SIMON, M. F. Manual de curadores de germoplasma - vegetal: conservação in situ. Brasília: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, Colombo, 322: 1-14, 2010.
VARSHNEY, R. K. et al. Comparative assessment of ESTSSR, EST-SNP and AFLP markers for evaluation of genetic diversity and conservation of genetic resources using wild, cultivated and elite barleys. Plant Science, 173: 628-649, 2007.
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